由于存放，運輸等過程可能將色譜柱管玷污或損壞，使用前應將色譜柱進行試漏與清洗。
        試漏的操作方法很簡單，只要將柱管全部浸入水中，將其出口填死，入口通入氮氣，在高于使用的操作壓力下，以管壁沒有氣泡冒出為合格。
       清洗的方法，因管柱的材料不同而異。
1、玻璃柱管可注入清洗液浸泡兩次（必要時使用溫熱的清洗液，效果更好），然后用自來水沖至中性，再用蒸餾水清洗。清潔的玻璃管內壁不應掛有水珠，否則還要用溫熱的清洗液洗滌，洗后用自來水沖至中性，再用蒸餾水清洗，烘干后備用。
2、對于不銹鋼柱管，可用5-10%的熱堿水溶液抽洗4-5次，以出去內壁的油污，然后用自來水沖洗至中性，再用蒸餾水清洗，烘干后備用。
3、對于銅柱管，可采用10%的鹽酸浸泡，并用水泵抽洗，直至抽洗液中無金屬銅銹或其他懸浮雜質為止，然后用自來水沖洗至中性，再用蒸餾水清洗，烘干后備用。
4、對于已經用過的色譜柱，需要重換其固定相時，柱管也應當用相應的溶劑（如乙醚、乙醇、熱堿液）依次洗滌，自來水沖至中性，然后用蒸餾水清洗，以除去柱管中的載體粉末及粘附在壁管上的固定液膜，烘干后備用。